78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1863 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  100 
 
 
583 aa  1167    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  54.92 
 
 
607 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  53.28 
 
 
609 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  55.08 
 
 
605 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  50.26 
 
 
594 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  50.81 
 
 
601 aa  538  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  45.65 
 
 
618 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  35.06 
 
 
547 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  35.13 
 
 
543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 
562 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  36.57 
 
 
608 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  33.09 
 
 
546 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  31.41 
 
 
550 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  32.04 
 
 
561 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  32.72 
 
 
562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  33.87 
 
 
647 aa  250  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  33.62 
 
 
655 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  30.66 
 
 
596 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 
587 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  29.02 
 
 
576 aa  190  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
814 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
583 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30.05 
 
 
560 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
564 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
609 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 
615 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 
599 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.79 
 
 
587 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 
596 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
515 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  30.2 
 
 
583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.32 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.93 
 
 
593 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
547 aa  123  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 
588 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  32.12 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.61 
 
 
534 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 
536 aa  92  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 
522 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  30.18 
 
 
414 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 
851 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 
527 aa  87  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
559 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 
547 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  23.91 
 
 
677 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  22.51 
 
 
513 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  25.42 
 
 
387 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
514 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.15 
 
 
355 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  22.28 
 
 
565 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  23.36 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.19 
 
 
462 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  22.5 
 
 
685 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  22.5 
 
 
685 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  22.8 
 
 
688 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.32 
 
 
763 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
847 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  23.88 
 
 
636 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.53 
 
 
490 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 
706 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  30.19 
 
 
335 aa  47  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  24.21 
 
 
394 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4156  von Willebrand factor, type A  32.57 
 
 
564 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.77 
 
 
344 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.64 
 
 
344 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.73 
 
 
760 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  26.67 
 
 
582 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.14 
 
 
791 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 
571 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
421 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.54 
 
 
794 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  36.84 
 
 
808 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
334 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>