52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7651 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1123    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  49.82 
 
 
599 aa  561  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  35.51 
 
 
596 aa  316  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 
587 aa  316  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  33.91 
 
 
814 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 
515 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  34.18 
 
 
586 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  30.93 
 
 
587 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  29.47 
 
 
584 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 
564 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  32.14 
 
 
576 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 
588 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 
593 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
607 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
583 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
583 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.03 
 
 
605 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 
608 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 
609 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 
615 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 
601 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  27.77 
 
 
655 aa  139  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  33.77 
 
 
355 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
594 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.35 
 
 
594 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 
636 aa  94  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  23.15 
 
 
647 aa  87  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  24.41 
 
 
677 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  24.95 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.94 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.21 
 
 
688 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  24.57 
 
 
685 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  24.57 
 
 
685 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  22.96 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.4 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  22.5 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.92 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.95 
 
 
851 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  23.13 
 
 
589 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
596 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
559 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  26.3 
 
 
283 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 
547 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  27.84 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  28.1 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
536 aa  43.5  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>