25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2768 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  39.1 
 
 
636 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  32.8 
 
 
685 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  32.8 
 
 
685 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  32.53 
 
 
688 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  33.24 
 
 
677 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  37.28 
 
 
640 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  33.76 
 
 
368 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  30.13 
 
 
224 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.01 
 
 
609 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  24.23 
 
 
605 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 
618 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.21 
 
 
550 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  22.12 
 
 
609 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  22.88 
 
 
608 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  24.23 
 
 
601 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  21.18 
 
 
594 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  24.01 
 
 
583 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
599 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
515 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  34.29 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.33 
 
 
560 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.97 
 
 
562 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>