121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1513 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  55.28 
 
 
609 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  70.6 
 
 
607 aa  852    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1234    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  56.09 
 
 
594 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  56.65 
 
 
601 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  54.05 
 
 
583 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  48.62 
 
 
618 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  35.05 
 
 
562 aa  297  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  34.71 
 
 
561 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  31.04 
 
 
550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 
562 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 
547 aa  265  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 
647 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.86 
 
 
546 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  32.56 
 
 
543 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 
608 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 
814 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 
615 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 
655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
587 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  27.97 
 
 
583 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 
609 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  28.71 
 
 
576 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.09 
 
 
584 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
564 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  27.29 
 
 
596 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  26.28 
 
 
587 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  27.56 
 
 
560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
599 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 
588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
586 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 
589 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 
594 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  27.54 
 
 
570 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
536 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 
522 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
547 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  33.19 
 
 
527 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 
534 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  26.49 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 
559 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.92 
 
 
851 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  25.43 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 
842 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  24.44 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  36.55 
 
 
2166 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  23.32 
 
 
677 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 
847 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30 
 
 
490 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  25.55 
 
 
387 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  33.18 
 
 
966 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.14 
 
 
851 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.08 
 
 
355 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  28.29 
 
 
951 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 
421 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  22.69 
 
 
394 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
579 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  29.82 
 
 
480 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 
972 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.8 
 
 
582 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  21.53 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  29.21 
 
 
787 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
914 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 
411 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.53 
 
 
643 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
640 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 
427 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
412 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.94 
 
 
629 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.43 
 
 
571 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
592 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  28.87 
 
 
761 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
754 aa  47.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  25.71 
 
 
368 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.62 
 
 
442 aa  47.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 
416 aa  47.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  37.09 
 
 
2887 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  24.52 
 
 
566 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 
828 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  25 
 
 
523 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 
505 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 
418 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 
555 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>