61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0312 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 564 aa  1112    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  38.19 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  33.86 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  35.6 
 
 		 814 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 		 587 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  35.65 
 
 		 547 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.95 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  32.33 
 
 		 608 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30.42 
 
 		 560 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 		 588 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  32.24 
 
 		 587 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.58 
 
 		 593 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 		 576 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  31 
 
 		 609 aa  193  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 		 615 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  33.4 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  29.54 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  29.37 
 
 		 584 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.2 
 
 		 618 aa  163  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 583 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.7 
 
 		 605 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  27.91 
 
 		 594 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 		 655 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 609 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.42 
 
 		 561 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.05 
 
 		 562 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  26.33 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.63 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  23.65 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.14 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  23.96 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  23.96 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  24.52 
 
 		 522 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 640 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.35 
 
 		 847 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 		 842 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 536 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 851 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  25.38 
 
 		 932 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 636 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  38.6 
 
 		 224 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 514 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.93 
 
 		 851 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.83 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1115  hypothetical protein  26.98 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.483933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  23.7 
 
 		 371 aa  43.9  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>