42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3098 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  59.8 
 
 
685 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  59.8 
 
 
685 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
640 aa  1252    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  59.83 
 
 
688 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  73.93 
 
 
636 aa  877    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  55.46 
 
 
677 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  36.64 
 
 
394 aa  183  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 
596 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.79 
 
 
587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.19 
 
 
584 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 
596 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  33.81 
 
 
368 aa  104  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.09 
 
 
560 aa  94.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
599 aa  90.9  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  24.59 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 
515 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  25.04 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  23.65 
 
 
609 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
607 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29 
 
 
547 aa  79  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
601 aa  77.4  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  24.53 
 
 
605 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  24.82 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 
587 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
583 aa  64.7  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
576 aa  63.9  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.66 
 
 
564 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  25.55 
 
 
583 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
562 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 
594 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.75 
 
 
562 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  25.21 
 
 
594 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
814 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.71 
 
 
561 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 
593 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  23.54 
 
 
583 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 
527 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>