42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2862 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  100 
 
 
685 aa  1354    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  100 
 
 
685 aa  1354    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  59.8 
 
 
640 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  98.55 
 
 
688 aa  1227    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  57.6 
 
 
636 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  54.68 
 
 
677 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  32.25 
 
 
394 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 
596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  31.22 
 
 
368 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  25.83 
 
 
587 aa  98.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  24.39 
 
 
560 aa  91.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.07 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 
599 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
814 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 
608 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  34.65 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  22.54 
 
 
588 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  22.97 
 
 
562 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  22.41 
 
 
607 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  23.81 
 
 
596 aa  65.1  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  22.81 
 
 
609 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  22.87 
 
 
618 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.15 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 
564 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  24.63 
 
 
605 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
583 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  23.43 
 
 
647 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
587 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  24.96 
 
 
655 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
594 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  28.15 
 
 
576 aa  51.2  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  22.03 
 
 
601 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  23.46 
 
 
583 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
583 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  29.18 
 
 
355 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 
615 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
593 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  31.29 
 
 
283 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  24.62 
 
 
594 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>