31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2330 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  32.97 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  34.18 
 
 		 677 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  32.15 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  31.9 
 
 		 685 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  31.9 
 
 		 685 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 636 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  33.52 
 
 		 640 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  35.95 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 		 618 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  28.91 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.22 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 		 599 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.37 
 
 		 560 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 		 515 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 587 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 		 609 aa  52.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 		 588 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  24.5 
 
 		 609 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  29.11 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 583 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  23.03 
 
 		 601 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  33.77 
 
 		 587 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 		 814 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.85 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 564 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>