49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  100 
 
 
583 aa  1151    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  37.14 
 
 
615 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
814 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 
596 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  32.25 
 
 
515 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  32.05 
 
 
586 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 
587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  33.85 
 
 
583 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  34.5 
 
 
576 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  32.24 
 
 
593 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 
564 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 
599 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 
609 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.87 
 
 
608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.39 
 
 
605 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
607 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.54 
 
 
587 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 
588 aa  156  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.31 
 
 
584 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.6 
 
 
560 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 
655 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 
547 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 
583 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  27.69 
 
 
594 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
609 aa  136  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  30.75 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  31.89 
 
 
527 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
618 aa  97.4  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
596 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
562 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  27.61 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 
550 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 
562 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.55 
 
 
543 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 
546 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  28.44 
 
 
685 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  28.44 
 
 
685 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  28.44 
 
 
688 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 
547 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  26.6 
 
 
677 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  23.75 
 
 
640 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
559 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  35.04 
 
 
647 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 
536 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.54 
 
 
851 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  24.14 
 
 
636 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
522 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>