55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3594 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  83.88 
 
 		 583 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 576 aa  1135    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  31.7 
 
 		 814 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 599 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  33.09 
 
 		 515 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 		 615 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 		 587 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  32.44 
 
 		 560 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 		 593 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 		 608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  33.92 
 
 		 583 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 		 564 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 		 607 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  26.99 
 
 		 587 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  29.02 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.35 
 
 		 609 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.75 
 
 		 584 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 547 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  29.11 
 
 		 605 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  27.92 
 
 		 594 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 601 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 618 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  29.23 
 
 		 655 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 		 594 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.85 
 
 		 561 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 562 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 		 647 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.72 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  21.43 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.24 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  30.22 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  35.77 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  24.5 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.2 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  29.2 
 
 		 677 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 522 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.29 
 
 		 851 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.57 
 
 		 691 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  28.15 
 
 		 688 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  28.15 
 
 		 685 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  28.15 
 
 		 685 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>