48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4775 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 615 aa  1221    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 583 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 		 583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 		 814 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 596 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 		 609 aa  207  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 599 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 		 586 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 607 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 		 515 aa  198  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  31.76 
 
 		 605 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 		 564 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  29.88 
 
 		 587 aa  190  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  29.4 
 
 		 587 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  30.22 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  31.83 
 
 		 655 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  26.84 
 
 		 584 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  28.67 
 
 		 594 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.26 
 
 		 593 aa  161  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 583 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 609 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 547 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 547 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 596 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 647 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 		 562 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 546 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 		 561 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 562 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  27.45 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  29.37 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  23.27 
 
 		 559 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 		 636 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 522 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  24.74 
 
 		 368 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  23.8 
 
 		 685 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  23.8 
 
 		 685 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  24.21 
 
 		 688 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2590  FHA domain-containing protein  24.02 
 
 		 785 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>