40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0012 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
851 aa  1666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0752  von Willebrand factor, type A  26.75 
 
 
678 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  27.74 
 
 
609 aa  99.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
607 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
583 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  26.89 
 
 
594 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.47 
 
 
605 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.14 
 
 
560 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
599 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  35 
 
 
1335 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9022  hypothetical protein  24.45 
 
 
688 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 
608 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0669  2-alkenal reductase  29.33 
 
 
524 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
547 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  40.26 
 
 
459 aa  48.5  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  33.82 
 
 
514 aa  47.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.71 
 
 
488 aa  47.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.1 
 
 
507 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.59 
 
 
334 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.71 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  36.23 
 
 
485 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
583 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1154  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
373 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  30 
 
 
499 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  44.12 
 
 
397 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  44.12 
 
 
397 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  34.12 
 
 
490 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  38.6 
 
 
504 aa  45.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  38.6 
 
 
473 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
647 aa  45.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.38 
 
 
451 aa  45.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.43 
 
 
382 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.04 
 
 
541 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
584 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.11 
 
 
488 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.11 
 
 
558 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.11 
 
 
526 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.11 
 
 
558 aa  44.3  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>