52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0463 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  100 
 
 
547 aa  1038    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  36.01 
 
 
564 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  32.4 
 
 
814 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  34.12 
 
 
596 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  34.64 
 
 
587 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 
515 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 
593 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  31.16 
 
 
587 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 
599 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 
609 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  29.66 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  31.64 
 
 
584 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
608 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  39.09 
 
 
594 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 
576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  33.27 
 
 
527 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 
588 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
583 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
601 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
607 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  32.7 
 
 
583 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  30.26 
 
 
605 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  29.34 
 
 
594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 
615 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 
618 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 
655 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 
583 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 
609 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  28.6 
 
 
636 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  25.81 
 
 
685 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  25.81 
 
 
685 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  26.04 
 
 
688 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
640 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
550 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.22 
 
 
561 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  27.47 
 
 
677 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.59 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 
562 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.64 
 
 
543 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  28.42 
 
 
355 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 
547 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  36.45 
 
 
570 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 
851 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  25.05 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  25.99 
 
 
394 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
627 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
642 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>