46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1377 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  64.29 
 
 		 587 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1170    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  33.71 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  31.92 
 
 		 814 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 		 599 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 		 515 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 		 596 aa  224  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.68 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 		 564 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  31.14 
 
 		 593 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  30.98 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 583 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 615 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 607 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.05 
 
 		 605 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 583 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 609 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  31.1 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  27.23 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  26.88 
 
 		 655 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 		 609 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 618 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  26.52 
 
 		 677 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 640 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.2 
 
 		 636 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 527 aa  87.4  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  21.28 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.3 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  27.57 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  26.74 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  26.74 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  21.09 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  22.02 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  21.74 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  22.06 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  21.36 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  21.78 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  22.06 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>