48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0747 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1169    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  64.29 
 
 
584 aa  737    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  33.83 
 
 
814 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  34.46 
 
 
596 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
515 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  33.93 
 
 
588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.71 
 
 
586 aa  236  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 
599 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  30.74 
 
 
560 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  31.59 
 
 
587 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  32.24 
 
 
564 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 
593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 
576 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.42 
 
 
615 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  31.19 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
583 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
608 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
583 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  28.62 
 
 
594 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
655 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.48 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  33.86 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
583 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
601 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.72 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
527 aa  103  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  23.33 
 
 
609 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.93 
 
 
636 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
562 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.45 
 
 
550 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  24.33 
 
 
647 aa  75.5  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  25.69 
 
 
677 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  27.57 
 
 
685 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  27.57 
 
 
685 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  27.57 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  23.19 
 
 
561 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.71 
 
 
543 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  22.64 
 
 
547 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 
596 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  25.49 
 
 
534 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  21.39 
 
 
562 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 
589 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  21.74 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  39.36 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 
559 aa  43.9  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>