59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1270 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  100 
 
 
593 aa  1138    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  36.06 
 
 
587 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  34.64 
 
 
596 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  34.25 
 
 
583 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  33.71 
 
 
515 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  34.52 
 
 
814 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  33.45 
 
 
576 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  32.37 
 
 
560 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 
564 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 
586 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  33.46 
 
 
599 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 
547 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  31.58 
 
 
587 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  33.49 
 
 
608 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  31.39 
 
 
584 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 
607 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  29.09 
 
 
609 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  30.91 
 
 
605 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 
588 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.83 
 
 
655 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  29.42 
 
 
594 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
583 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
601 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
618 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
527 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.28 
 
 
561 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 
647 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 
562 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
550 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 
562 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  31.71 
 
 
355 aa  87  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
547 aa  81.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.02 
 
 
543 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 
609 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  22.87 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  27.22 
 
 
677 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  30.19 
 
 
640 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 
547 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
596 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.3 
 
 
589 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
842 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 
559 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
847 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 
932 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 
851 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 
570 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  27.61 
 
 
688 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
329 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  26.96 
 
 
636 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  27.42 
 
 
685 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  27.42 
 
 
685 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  32.04 
 
 
416 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
334 aa  43.9  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 
1077 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>