59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3738 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  100 
 
 
609 aa  1241    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  28.6 
 
 
607 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.92 
 
 
609 aa  187  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.91 
 
 
605 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 
601 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.79 
 
 
618 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
583 aa  169  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
608 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  29.42 
 
 
655 aa  157  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 
599 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
583 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  28.05 
 
 
560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  27.17 
 
 
594 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
615 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 
814 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
647 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  25.57 
 
 
584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 
587 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  25.85 
 
 
576 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 
596 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 
562 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 
564 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  24.22 
 
 
561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  23.33 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
546 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  25.04 
 
 
547 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
550 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
547 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 
515 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.63 
 
 
562 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  22.78 
 
 
586 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 
543 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.39 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
594 aa  73.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  24.18 
 
 
640 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  23.46 
 
 
589 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  22.46 
 
 
677 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 
570 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  23.42 
 
 
636 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 
559 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 
527 aa  62.4  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  22.69 
 
 
547 aa  60.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  23.64 
 
 
685 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  23.64 
 
 
685 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  23.84 
 
 
688 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  26.96 
 
 
795 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  24.01 
 
 
414 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.59 
 
 
851 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  23.12 
 
 
414 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  22.91 
 
 
514 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 
715 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  23.7 
 
 
436 aa  44.3  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>