21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0945 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  100 
 
 
2166 aa  4389    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  36.55 
 
 
605 aa  71.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 
607 aa  68.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  29.66 
 
 
609 aa  55.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.72 
 
 
753 aa  55.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 
411 aa  50.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0547  von Willebrand factor, type A  29.8 
 
 
656 aa  49.7  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.58181  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
592 aa  49.7  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
412 aa  48.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.77 
 
 
791 aa  48.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.94 
 
 
680 aa  49.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.07 
 
 
442 aa  48.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.77 
 
 
794 aa  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  28.18 
 
 
770 aa  48.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.11 
 
 
740 aa  48.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
547 aa  47.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
546 aa  47  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.22 
 
 
751 aa  47  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
842 aa  46.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49216  predicted protein  27.21 
 
 
694 aa  45.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.88 
 
 
725 aa  45.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>