87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1248 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  100 
 
 
592 aa  1202    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  27.9 
 
 
523 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  22.22 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
808 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 
612 aa  67  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.82 
 
 
460 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
472 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
640 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  23.68 
 
 
613 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 
416 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
966 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.26 
 
 
472 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 
610 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  23.43 
 
 
625 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
500 aa  58.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.47 
 
 
490 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  25.33 
 
 
615 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  21.97 
 
 
563 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  22.08 
 
 
792 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  24.13 
 
 
459 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 
592 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.31 
 
 
621 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 
425 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  22.4 
 
 
708 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  23.43 
 
 
624 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.35 
 
 
442 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
425 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
918 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 
562 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
467 aa  54.3  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  23.2 
 
 
566 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
639 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
430 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.28 
 
 
629 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 
393 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
555 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 
561 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 
412 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 
642 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  24.4 
 
 
686 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  21.96 
 
 
633 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
505 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.8 
 
 
334 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
547 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  22.56 
 
 
698 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 
642 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  23.92 
 
 
914 aa  50.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 
642 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 
972 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
2166 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.59 
 
 
451 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.6 
 
 
543 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 
412 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.42 
 
 
423 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  22.88 
 
 
859 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  34.1 
 
 
958 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.16 
 
 
1188 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  22.37 
 
 
706 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3412  von Willebrand factor, type A  32.99 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0316076  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 
607 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 
419 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.69 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 
892 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 
903 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
418 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 
654 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.55 
 
 
712 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  20.65 
 
 
651 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
546 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 
352 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  21.24 
 
 
625 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  24.87 
 
 
333 aa  43.5  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.26 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>