26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1374 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  773    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 
522 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  38.31 
 
 
513 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
514 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 
536 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
547 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
559 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  28.11 
 
 
534 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  32.52 
 
 
543 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
547 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 
562 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 
561 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
546 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.53 
 
 
847 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 
607 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
618 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
550 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 
1188 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 
570 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  26.55 
 
 
605 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 
334 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.53 
 
 
423 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>