229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2681 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 334 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  80.62 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  79.58 
 
 		 340 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  76.43 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  78.89 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  77.44 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  79.58 
 
 		 339 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  78.89 
 
 		 339 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  77.1 
 
 		 338 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  77.1 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  79.24 
 
 		 330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  73.97 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  72.85 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  70.79 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  73.74 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  69.44 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  51.1 
 
 		 349 aa  325  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  50.81 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  51.13 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  47.28 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  45.92 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  48.84 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  56.8 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  52.49 
 
 		 334 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  47.96 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  46.37 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.63 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  50 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  42.9 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  45.67 
 
 		 358 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  44.21 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  45.67 
 
 		 358 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.67 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  44.14 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  50.79 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  49.38 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  43.88 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  47.32 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  42.5 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  43.12 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  50.2 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  42.54 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  43.91 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  40.13 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.2 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  42.51 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  40 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  38.62 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  35.08 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  38.22 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  35.08 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  37.18 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  35.08 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  39.69 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  38.27 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  38.33 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  38.19 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  35.77 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  36.4 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  32.12 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  36.68 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  37.4 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  35.46 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  39.36 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  37.89 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  39.43 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  36.72 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  35.62 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  33.33 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  35.19 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  38.58 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  33.86 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  34.72 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  33.47 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  36.75 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  34.63 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  32.15 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  37.6 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  36.08 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  37.92 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  34.87 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  33.89 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  35.68 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  36.78 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  35.65 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  35.15 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  30.22 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  29.57 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.57 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  36.19 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>