245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3278 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  99.09 
 
 		 328 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  62.61 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  48.74 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  49.03 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  48.38 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  50.88 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  48.05 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  49.12 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  46.42 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  46.8 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  43.04 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  41.72 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  43.09 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  38.56 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.53 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  36.64 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  36.3 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  45.12 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  36.99 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  35.79 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  37.27 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.32 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  35.62 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  35.96 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  35.93 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  35.67 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  37.11 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.04 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  38.7 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  39.04 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  33.63 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  34.67 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  35.09 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  32.31 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  38.05 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  33.69 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.1 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  35.53 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  36.76 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  34.19 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 		 349 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  38.26 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  37.94 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.17 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  39.93 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  33.79 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  41.33 
 
 		 337 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  38.36 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  35.14 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  36.99 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  31.96 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  31.27 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  30.93 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  34.6 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  30.24 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  33.69 
 
 		 377 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  40.8 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  34.08 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  36.28 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  34.66 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  35.69 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  36.16 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  35.34 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  30.03 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  31.56 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  27.13 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.39 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  38.03 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  34.71 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  34.45 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  33.51 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.89 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  33.58 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  36.2 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  30.94 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.85 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.05 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.62 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>