217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2172 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  71.61 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  71.19 
 
 
338 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  70.63 
 
 
339 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  70.16 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  70.63 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  69.31 
 
 
339 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  69.64 
 
 
340 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  69.31 
 
 
340 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  68.98 
 
 
339 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  70.03 
 
 
336 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  69.52 
 
 
330 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  69.18 
 
 
330 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  69.15 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  69.23 
 
 
330 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  69.04 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  49.22 
 
 
349 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  50.49 
 
 
343 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  51.46 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  46.79 
 
 
320 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  47.02 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  52.36 
 
 
334 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  49.13 
 
 
341 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  47.73 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  47.99 
 
 
345 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  46.32 
 
 
359 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  54.36 
 
 
327 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  45.45 
 
 
339 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  47.23 
 
 
342 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.44 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.73 
 
 
358 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  46.73 
 
 
358 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  46.41 
 
 
358 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  45.22 
 
 
335 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  39.82 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  39.52 
 
 
344 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  47.85 
 
 
358 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  50.8 
 
 
334 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  44.52 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  51.71 
 
 
337 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  43.41 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  43.04 
 
 
352 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  46.77 
 
 
334 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  40.06 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.68 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  41.18 
 
 
328 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
324 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  35.87 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  36.92 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  37.23 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  39.61 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 
335 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  39.6 
 
 
328 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  40.15 
 
 
340 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  41.53 
 
 
337 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  35.95 
 
 
339 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  36.07 
 
 
339 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 
339 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  38.68 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  37.26 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  36.99 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  37.26 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  32.73 
 
 
356 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  38.55 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  38.62 
 
 
329 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 
342 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  35.5 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  41.63 
 
 
282 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  38.19 
 
 
327 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 
334 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  37.85 
 
 
328 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  34.52 
 
 
377 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  37.45 
 
 
328 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  34.08 
 
 
336 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 
333 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  33.58 
 
 
334 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  36.44 
 
 
373 aa  142  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  37.19 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  35.17 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 
309 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  36.58 
 
 
327 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
328 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  34.13 
 
 
330 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  34.89 
 
 
328 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  32.87 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 
339 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 
331 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  29.53 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.39 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  31.27 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.72 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  32.39 
 
 
329 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  32.31 
 
 
344 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30.12 
 
 
317 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>