246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1384 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 319 aa  624  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  87.21 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  47.02 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  45.45 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  45.91 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  51.26 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  49.01 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  48.68 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  48.29 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  44.51 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  49.69 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  43.96 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  44.95 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  43.57 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  47.02 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  45.95 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  45.95 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  45.95 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  43.55 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  48.11 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  40.06 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  42.3 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  45.79 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  44.96 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  33 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  39.21 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  40.2 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  40.38 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  33.58 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  34.69 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  37.45 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  32.39 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  35.35 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  32.33 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.55 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  31.83 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  34.69 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  29.58 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.24 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.12 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.7 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.03 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 		 754 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  33.85 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  35.19 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.65 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.03 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  32.63 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  31.03 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  33.05 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  32.42 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  30.88 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.7 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  31.4 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  30.74 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  29.09 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.21 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.07 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  30.63 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  29.54 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  32.49 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  30.6 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  32.42 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  28.23 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.06 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>