222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3026 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
316 aa  627  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  93.04 
 
 
316 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  60 
 
 
316 aa  378  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  55.49 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  48.72 
 
 
315 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  48.99 
 
 
315 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  47.13 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  49.83 
 
 
319 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  50.17 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  50.17 
 
 
315 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  46.39 
 
 
320 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  51.58 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  49.69 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  46.67 
 
 
321 aa  251  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  48.65 
 
 
319 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  46.37 
 
 
335 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  45.33 
 
 
335 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  46.37 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  46.37 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  46.37 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  39.62 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  43.44 
 
 
326 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  45.67 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  44.29 
 
 
325 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  44.57 
 
 
319 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.07 
 
 
345 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 
354 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  35.22 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  36.05 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  33.74 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  34.73 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  36.3 
 
 
317 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  33.23 
 
 
346 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  29.64 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  32.05 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  31.8 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  32 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  38.34 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.3 
 
 
317 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 
316 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
334 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  27.86 
 
 
351 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  29.68 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  30.67 
 
 
327 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.04 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  30.48 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.35 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  32.88 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  33.61 
 
 
359 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  25 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  32.59 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.63 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  31.87 
 
 
339 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.77 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.17 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.5 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  32.6 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.4 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  32.1 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  30.13 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  29.79 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
701 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  26.29 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.07 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  30.43 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.75 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  32.76 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 
595 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  24.05 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  30.2 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.52 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.88 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  29.09 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>