255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1678 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  66.67 
 
 
315 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  55.24 
 
 
315 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  55.87 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  49.84 
 
 
319 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  55.87 
 
 
315 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  50.62 
 
 
319 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  47.15 
 
 
316 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  49.84 
 
 
319 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  47.34 
 
 
319 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  48.9 
 
 
316 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  41.99 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  41.18 
 
 
320 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  43.1 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  45.94 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  49.21 
 
 
316 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  38.56 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  38.56 
 
 
335 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  38.96 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  36.11 
 
 
327 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  38.04 
 
 
335 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  38.04 
 
 
335 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  38.04 
 
 
335 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  41.19 
 
 
325 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  39.66 
 
 
319 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  33.72 
 
 
345 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  37.58 
 
 
317 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  33.44 
 
 
354 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
319 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  34.6 
 
 
308 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  39.92 
 
 
313 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 
346 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  35.76 
 
 
355 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 
358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  30.62 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
332 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.07 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.72 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.51 
 
 
316 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.88 
 
 
373 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.08 
 
 
339 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 
329 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
359 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  32.16 
 
 
335 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
334 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.62 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.57 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  32.48 
 
 
330 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  29.75 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  26.91 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  32.49 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  31.02 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  29.73 
 
 
377 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 
595 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  31.12 
 
 
643 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  31.42 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  29.82 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.45 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.86 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  30.7 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.06 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.91 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  30.16 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
754 aa  79.7  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.06 
 
 
344 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.08 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  33.76 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  30.53 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.95 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  32.88 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>