215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  68.4 
 
 
321 aa  424  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  58.59 
 
 
335 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  58.59 
 
 
335 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  58.28 
 
 
335 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  58.28 
 
 
335 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  58.28 
 
 
335 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  58.59 
 
 
335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  58.88 
 
 
325 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  51.85 
 
 
327 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  53.4 
 
 
320 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  41.45 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  43.46 
 
 
319 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  42.41 
 
 
315 aa  231  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  43.1 
 
 
315 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  42.81 
 
 
319 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  47.35 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  43.44 
 
 
316 aa  222  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  38.94 
 
 
316 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  43.55 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  44.03 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  43.75 
 
 
316 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  42.11 
 
 
319 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  39.25 
 
 
315 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  32.05 
 
 
354 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  39.44 
 
 
319 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  30.7 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 
353 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.74 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  36.24 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 
354 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 
319 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  32.24 
 
 
358 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  31.82 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 
354 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  33.03 
 
 
318 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 
316 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 
329 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  32 
 
 
327 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  28.99 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.48 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  33.77 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  27.44 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.84 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  24.85 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.71 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25.78 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.99 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.29 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  28.71 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
533 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  26.48 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  24.83 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  21.2 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  23.64 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.6 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.5 
 
 
643 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.97 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  33.49 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  25 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
644 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  25.51 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  26.27 
 
 
892 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
754 aa  62.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  29.92 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  27.71 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  25.42 
 
 
334 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.91 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.85 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  33.03 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.37 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  31.67 
 
 
667 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>