252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2147 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  68.4 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  58.28 
 
 
335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  56.43 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  57.36 
 
 
335 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  57.36 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  57.36 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  57.36 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  57.36 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  53.85 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  49.69 
 
 
327 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  47.19 
 
 
319 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  46.86 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  50.79 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  41.46 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  42.59 
 
 
316 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  46.67 
 
 
316 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  45.45 
 
 
319 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  47.62 
 
 
316 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 
315 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  43.57 
 
 
319 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  40.33 
 
 
315 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  40.98 
 
 
315 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  43.53 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  43.25 
 
 
319 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  38.7 
 
 
313 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  35.96 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  32.57 
 
 
354 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 
345 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  35.25 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  32.44 
 
 
353 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  35.23 
 
 
319 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  32.56 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.69 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  35.98 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  36.05 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 
354 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  31.54 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 
316 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
298 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.42 
 
 
316 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.7 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  31.32 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.32 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 
347 aa  95.5  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  32.64 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  25.78 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  27.7 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
329 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.33 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  27.66 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.26 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.74 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  30.8 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  29.33 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  30.42 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.1 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  27.5 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  33.05 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.46 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  31.05 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  30.6 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  31.31 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  29.24 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  29.17 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  28.98 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  31.94 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.86 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.87 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 
754 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
892 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  28.76 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.25 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.5 
 
 
643 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.94 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>