273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02145 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  702    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  59.3 
 
 
344 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  54.07 
 
 
347 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  39.3 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  40.52 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.61 
 
 
339 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 
611 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 
334 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  32.23 
 
 
334 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 
337 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
337 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.68 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
320 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  29.97 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  27.99 
 
 
337 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.72 
 
 
327 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  29.75 
 
 
336 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 
595 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25 
 
 
330 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 
359 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
336 aa  119  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  32.3 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
320 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  33.74 
 
 
331 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 
331 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 
327 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.37 
 
 
344 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.07 
 
 
328 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.37 
 
 
344 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  24.92 
 
 
346 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  26.97 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  25.5 
 
 
331 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.08 
 
 
651 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  26.64 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
533 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  27.87 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  27.87 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  27.87 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
340 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.11 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.12 
 
 
328 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.94 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  30.47 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 
344 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.66 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  29.6 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25.33 
 
 
601 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  33.93 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.3 
 
 
599 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
334 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  29.29 
 
 
352 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28 
 
 
345 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 
334 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  27.66 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
647 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.45 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 
658 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 
319 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 
754 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  25.27 
 
 
341 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  23.82 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  26.61 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
701 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>