207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1220 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
337 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0457  hypothetical protein  35.74 
 
 
340 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.367166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  32.04 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  31.27 
 
 
344 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
344 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 
345 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  31.17 
 
 
344 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.48 
 
 
339 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 
335 aa  99.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.79 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
331 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  26.22 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 
336 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 
611 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
571 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 
595 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.3 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.67 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  29.39 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  24.1 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.4 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 
572 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
572 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  23.87 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.91 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.84 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.38 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.97 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
572 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  27.34 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.48 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.3 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.65 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  24.41 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  25.18 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  26.18 
 
 
667 aa  69.3  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  27.27 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  22.61 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  26.62 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  24.56 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  24.33 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.07 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.36 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  24.21 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  24.78 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  24.92 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  29.83 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  25.3 
 
 
607 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  24.89 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  24.83 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  24.58 
 
 
334 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  29.89 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>