209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2085 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  100 
 
 
336 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  40.41 
 
 
339 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  37.39 
 
 
343 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  38.12 
 
 
337 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  38.01 
 
 
334 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  38.21 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  30.11 
 
 
346 aa  132  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
335 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 
345 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 
347 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 
344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.17 
 
 
339 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  33.66 
 
 
344 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  35.17 
 
 
339 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
344 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
320 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  25.88 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  34.72 
 
 
315 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  30 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  35.45 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  34.77 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  34.77 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.96 
 
 
336 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  29.09 
 
 
651 aa  85.9  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
571 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  30.67 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 
611 aa  82.8  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.03 
 
 
599 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  27.56 
 
 
572 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
572 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  26.77 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  28.93 
 
 
667 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
612 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  27.51 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  27.87 
 
 
607 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27 
 
 
573 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  27.13 
 
 
310 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
690 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  36.73 
 
 
589 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
658 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.38 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  28.31 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  33.75 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
647 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.85 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  31.66 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.52 
 
 
576 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  27.45 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.29 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  33.94 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.7 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  30.47 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  26.88 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.33 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  30.54 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.61 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  27.19 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
595 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
693 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  28.57 
 
 
585 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  31.84 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  24.89 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
650 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
664 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
692 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.9 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.98 
 
 
692 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.96 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
690 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
693 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
517 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
701 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>