191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3893 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
346 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  79.77 
 
 
345 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  77.87 
 
 
354 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  66.86 
 
 
350 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  66.67 
 
 
355 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  50.84 
 
 
354 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  51.69 
 
 
353 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  45.38 
 
 
358 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  38.6 
 
 
319 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 
315 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  34.86 
 
 
321 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  35.67 
 
 
319 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  35.37 
 
 
319 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  34.91 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 
315 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 
315 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  31.64 
 
 
327 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  33.66 
 
 
326 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  32.42 
 
 
315 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  34.8 
 
 
313 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  35.63 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  32.62 
 
 
335 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  32.31 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  32.31 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  32.31 
 
 
335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  36.79 
 
 
319 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  32.62 
 
 
335 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  33.72 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  35.92 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  33.04 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  35.38 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  33.97 
 
 
354 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  33.54 
 
 
318 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  33.12 
 
 
335 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 
318 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  33.92 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  32.01 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  31.39 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.36 
 
 
334 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  34.26 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.51 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  32.72 
 
 
298 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  28.35 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  30.08 
 
 
334 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
316 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 
328 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 
329 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.97 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 
359 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.21 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  25.83 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  29.2 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.31 
 
 
320 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.31 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.13 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.25 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.09 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.08 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  30.45 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.3 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  25.78 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.61 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  30.43 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.74 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  27.74 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.36 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  30.4 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  29.28 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  30.71 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26.97 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  27.16 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  27.21 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.31 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.56 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.31 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.68 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.12 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  29.14 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.67 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.57 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  29 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>