227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2088 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 318 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  54.88 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  49.68 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  55.49 
 
 		 316 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3252  von Willebrand factor type A  55.49 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152867  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  50.79 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  51.26 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  47.65 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  46.37 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  48.58 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  47.51 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  50.17 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  46.18 
 
 		 335 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  49.17 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  46.53 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2377  von Willebrand factor type A  51.86 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  46.84 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  46.84 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  46.84 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  46.69 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11510  hypothetical protein  45.85 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  47.04 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  42.14 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  47.39 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  43.68 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  42.34 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1241  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3247  von Willebrand factor, type A  34.04 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  36.31 
 
 		 308 aa  146  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4905  hypothetical protein  39.8 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2317  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3893  von Willebrand factor, type A  33.54 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.105671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  31.9 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1646  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  31.31 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1061  von Willebrand factor, type A  32.65 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  32.72 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.75 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  39.61 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3037  hypothetical protein  28.52 
 
 		 351 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1316  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0667351  normal  0.163551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.89 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.31 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  34.9 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.2 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  29.64 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  31 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  34.84 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.29 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 338 aa  89.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  32.37 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.85 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.23 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.44 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  31.48 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.33 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.92 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.4 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.22 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.22 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  32.59 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  29.43 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  22.84 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  29.88 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.95 
 
 		 643 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>