148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1421 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 329 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  66.03 
 
 		 696 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  67.56 
 
 		 265 aa  328  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.44 
 
 		 688 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  40.62 
 
 		 650 aa  232  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  41.1 
 
 		 653 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  42.63 
 
 		 670 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  43.4 
 
 		 660 aa  202  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  40.65 
 
 		 689 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  37.23 
 
 		 617 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  37.88 
 
 		 680 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  43.7 
 
 		 669 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  35.96 
 
 		 612 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  47.31 
 
 		 657 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  43.14 
 
 		 713 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  47.15 
 
 		 705 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.74 
 
 		 665 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.87 
 
 		 653 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.14 
 
 		 674 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  38.56 
 
 		 637 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.35 
 
 		 673 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  37.5 
 
 		 619 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  29.48 
 
 		 643 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  44.53 
 
 		 738 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.33 
 
 		 621 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  44.92 
 
 		 730 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  39.74 
 
 		 674 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.7 
 
 		 664 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.37 
 
 		 668 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  38.38 
 
 		 683 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.02 
 
 		 618 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.69 
 
 		 678 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.48 
 
 		 616 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.21 
 
 		 672 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.21 
 
 		 671 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  43.95 
 
 		 719 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  39.18 
 
 		 618 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.37 
 
 		 619 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  38.7 
 
 		 680 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.96 
 
 		 619 aa  143  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  35.04 
 
 		 800 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  42.19 
 
 		 608 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.8 
 
 		 620 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  38.37 
 
 		 618 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  42.63 
 
 		 610 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.66 
 
 		 673 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.66 
 
 		 673 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.84 
 
 		 677 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.14 
 
 		 788 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.05 
 
 		 717 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.05 
 
 		 717 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  43.85 
 
 		 699 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.84 
 
 		 701 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.57 
 
 		 721 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.54 
 
 		 674 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.55 
 
 		 725 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  34.71 
 
 		 690 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0107  magnesium chelatase  34.91 
 
 		 178 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0353838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  50.93 
 
 		 690 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.67 
 
 		 727 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  35.69 
 
 		 714 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  30.67 
 
 		 711 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.9 
 
 		 703 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.23 
 
 		 636 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  40.77 
 
 		 629 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  35.94 
 
 		 614 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.51 
 
 		 622 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.51 
 
 		 622 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.51 
 
 		 622 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  39.84 
 
 		 618 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  39.06 
 
 		 638 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  40.39 
 
 		 626 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  37.37 
 
 		 719 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  35.88 
 
 		 654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  36.48 
 
 		 749 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  47.13 
 
 		 754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  44.03 
 
 		 776 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  34.91 
 
 		 605 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  35.19 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3732  magnesium chelatase subunit D  40 
 
 		 581 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  0.103365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  35.36 
 
 		 563 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  40.76 
 
 		 573 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  39.84 
 
 		 566 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  36.04 
 
 		 582 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  40.27 
 
 		 614 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  33.33 
 
 		 257 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  32.68 
 
 		 587 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  35.66 
 
 		 599 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1021  magnesium chelatase subunit D  38.36 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0648816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  37.2 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  27.32 
 
 		 592 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  32.65 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 599 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.41 
 
 		 600 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0274  magnesium chelatase subunit D  37.67 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1917  magnesium chelatase subunit D  37.67 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  33.58 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  37.69 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  32.26 
 
 		 607 aa  63.5  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>