48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0123 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 491 aa  981    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0125  von Willebrand factor type A  34.41 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.178394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0124  hypothetical protein  47.55 
 
 		 450 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.263476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 903 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  36.43 
 
 		 1446 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  33.94 
 
 		 744 aa  60.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 795 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 		 592 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  33.11 
 
 		 521 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  29.52 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 		 1188 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  35 
 
 		 319 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 892 aa  50.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  22.07 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.86 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.44 
 
 		 317 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  34 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 		 972 aa  47.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  31 
 
 		 1100 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  30.81 
 
 		 322 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4476  von Willebrand factor, type A  40.26 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.06 
 
 		 729 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 		 958 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.43 
 
 		 723 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 972 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2505  von Willebrand factor, type A  27.16 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 628 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  29.2 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  28.95 
 
 		 750 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 298 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.49 
 
 		 771 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 1300 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>