132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1866 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
628 aa  1285    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3344  von Willebrand factor, type A  40.22 
 
 
356 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2505  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 
430 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0705  hypothetical protein  30.49 
 
 
334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 
362 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
349 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3941  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
325 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3993  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 
391 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2299  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0771  hypothetical protein  28.15 
 
 
286 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.48 
 
 
643 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  31.67 
 
 
233 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3008  von Willebrand factor, type A  22.58 
 
 
341 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.780877  decreased coverage  0.000171728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 
972 aa  55.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
319 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 
452 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3561  hypothetical protein  26.2 
 
 
399 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239873  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
308 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.79 
 
 
706 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
405 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  34.95 
 
 
334 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1366  von Willebrand factor, type A  24.19 
 
 
491 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808281  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
356 aa  52.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 
542 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
371 aa  52  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  33.64 
 
 
578 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
243 aa  51.6  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
416 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
1421 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 
738 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.94 
 
 
462 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 
808 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
550 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
376 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
3560 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.57 
 
 
706 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
353 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
306 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  36.05 
 
 
306 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.41 
 
 
739 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  28 
 
 
442 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 
324 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 
615 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.24 
 
 
620 aa  48.5  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
3035 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
265 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.71 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  30.71 
 
 
219 aa  47.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
280 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 
472 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
715 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
399 aa  47.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  24.88 
 
 
307 aa  47.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.67 
 
 
730 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
878 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
252 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
234 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
425 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  37.8 
 
 
216 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  23.41 
 
 
316 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.71 
 
 
472 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 
334 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
870 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
1188 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
267 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
649 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  31.82 
 
 
539 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.88 
 
 
1764 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
2240 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
200 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.74 
 
 
810 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3382  FHA domain containing protein  27.41 
 
 
564 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 
357 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 
626 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
247 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
196 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
331 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  33.67 
 
 
582 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.84 
 
 
739 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 
320 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 
343 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  35.62 
 
 
252 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
632 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
359 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.7 
 
 
937 aa  45.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
1096 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
273 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 
1198 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
284 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  27.96 
 
 
725 aa  44.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
406 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>