17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0705 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0705  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3993  von Willebrand factor, type A  36.25 
 
 
391 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3344  von Willebrand factor, type A  37.25 
 
 
356 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  29.93 
 
 
349 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2505  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 
362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1866  von Willebrand factor, type A  31.82 
 
 
628 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3561  hypothetical protein  29.9 
 
 
399 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239873  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0706  hypothetical protein  25.07 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0771  hypothetical protein  30.04 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  24.55 
 
 
643 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3008  von Willebrand factor, type A  23.11 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.780877  decreased coverage  0.000171728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0913  hypothetical protein  29.87 
 
 
601 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  23.86 
 
 
1313 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4012  hypothetical protein  32.47 
 
 
601 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679014  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  26.19 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>