More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3323 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  100 
 
 		 578 aa  1181    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 1406 aa  257  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  33.58 
 
 		 725 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  32.2 
 
 		 669 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  33.58 
 
 		 700 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  30.51 
 
 		 1764 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 697 aa  216  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  32.81 
 
 		 663 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  32.69 
 
 		 542 aa  207  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  32.36 
 
 		 648 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  33.27 
 
 		 673 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  34.48 
 
 		 720 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.73 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  34.12 
 
 		 536 aa  197  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  35.35 
 
 		 525 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  28.12 
 
 		 652 aa  194  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  30.09 
 
 		 717 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  30.06 
 
 		 889 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  32.22 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  32.28 
 
 		 542 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  32.03 
 
 		 634 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 713 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  32.95 
 
 		 677 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 899 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.36 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  30.9 
 
 		 604 aa  170  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  28.31 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  35.12 
 
 		 322 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.47 
 
 		 656 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  29.04 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  29.51 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  31 
 
 		 670 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.83 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  25.64 
 
 		 742 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.59 
 
 		 762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.59 
 
 		 762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  26.01 
 
 		 488 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  29.63 
 
 		 531 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 685 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  26.3 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.45 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  33.2 
 
 		 624 aa  120  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  22.2 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  23.65 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.13 
 
 		 625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.19 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  21.14 
 
 		 529 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  30.94 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 538 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 709 aa  95.1  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.08 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  22.14 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.54 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  29.32 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 878 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  25.47 
 
 		 471 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.21 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.87 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.8 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.83 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.24 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.88 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 3145 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.46 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.75 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.63 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.84 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1069 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 1022 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 1037 aa  61.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 927 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  28.99 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 3560 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 3035 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.71 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 4079 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.23 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 718 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 968 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.38 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>