62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1699 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  36.89 
 
 
525 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  30.03 
 
 
652 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  34.11 
 
 
536 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.87 
 
 
527 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  28.25 
 
 
717 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  28.25 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  26.93 
 
 
532 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  30.07 
 
 
530 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
1406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  29.37 
 
 
634 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  29.43 
 
 
720 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
530 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.47 
 
 
1764 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  26.42 
 
 
663 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  30.77 
 
 
656 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.05 
 
 
648 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.94 
 
 
578 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.19 
 
 
488 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  29.67 
 
 
542 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  27.94 
 
 
669 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 
542 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.05 
 
 
695 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  26.13 
 
 
637 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.16 
 
 
546 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  31.14 
 
 
700 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.13 
 
 
725 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  29.72 
 
 
677 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.04 
 
 
531 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
573 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  28.39 
 
 
673 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 
604 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  27.24 
 
 
533 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  31.18 
 
 
624 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  28.91 
 
 
670 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  25.91 
 
 
524 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
697 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  26.09 
 
 
889 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  26.3 
 
 
762 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.3 
 
 
762 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  19.74 
 
 
685 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  20.19 
 
 
514 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 
899 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.57 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
713 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  29.94 
 
 
636 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  23.72 
 
 
742 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.38 
 
 
549 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  18.95 
 
 
484 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  19.16 
 
 
494 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  20.66 
 
 
594 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.75 
 
 
471 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
510 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  18.97 
 
 
502 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.62 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
709 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  25.49 
 
 
625 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
1037 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  21.52 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  25.55 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>