More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1288 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  100 
 
 
636 aa  1304    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  31.32 
 
 
625 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.54 
 
 
695 aa  161  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  26.59 
 
 
624 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
538 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.91 
 
 
637 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.81 
 
 
648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.71 
 
 
656 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.16 
 
 
1764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
697 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  26.75 
 
 
669 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  26.8 
 
 
673 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
1406 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  26.87 
 
 
663 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  34.42 
 
 
725 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
685 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.44 
 
 
652 aa  136  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  37.7 
 
 
536 aa  134  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  31.27 
 
 
542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  26.6 
 
 
700 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  25.14 
 
 
542 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  33.85 
 
 
525 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  26.39 
 
 
677 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
573 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.45 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  26.22 
 
 
889 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  23.78 
 
 
531 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
899 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  22.18 
 
 
546 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  30.11 
 
 
742 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.53 
 
 
762 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  29.71 
 
 
527 aa  110  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.53 
 
 
762 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  32.51 
 
 
670 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  24.29 
 
 
604 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  24.5 
 
 
530 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  31.65 
 
 
634 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  23.61 
 
 
594 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  21.93 
 
 
529 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  23.93 
 
 
524 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 
530 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  30.97 
 
 
626 aa  97.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  25.5 
 
 
720 aa  97.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  25.21 
 
 
614 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
713 aa  97.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  25.65 
 
 
717 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  26.47 
 
 
514 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 
548 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  30.04 
 
 
532 aa  94  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
502 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
494 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  26.34 
 
 
484 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
598 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  28.81 
 
 
322 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
3560 aa  87.4  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  26.54 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
3035 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.11 
 
 
810 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
878 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1085 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.37 
 
 
875 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  26.16 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  24.07 
 
 
519 aa  83.6  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  27.3 
 
 
488 aa  83.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
718 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.93 
 
 
622 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.86 
 
 
626 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.69 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.69 
 
 
614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
1252 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
4489 aa  80.5  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 
626 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.38 
 
 
764 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.84 
 
 
739 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.87 
 
 
1676 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1827 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
612 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
649 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
635 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
1252 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
273 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
732 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
1094 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.57 
 
 
594 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
828 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
828 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
636 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.5 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.92 
 
 
626 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
732 aa  75.5  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
3145 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.78 
 
 
725 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>