122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0446 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  100 
 
 
592 aa  1222    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 
599 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  29.81 
 
 
696 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.14 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 
265 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  29.55 
 
 
643 aa  75.1  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  24.12 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30 
 
 
674 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.86 
 
 
653 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  27.88 
 
 
657 aa  71.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  28.9 
 
 
705 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
699 aa  71.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.64 
 
 
660 aa  70.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  29.82 
 
 
719 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.68 
 
 
688 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  28.93 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  26.92 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.73 
 
 
673 aa  67  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  25.68 
 
 
614 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  29.83 
 
 
629 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  25.37 
 
 
653 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.93 
 
 
665 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.32 
 
 
671 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 
272 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.75 
 
 
673 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  31.82 
 
 
713 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.75 
 
 
673 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.9 
 
 
678 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.12 
 
 
622 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  31.34 
 
 
637 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.12 
 
 
622 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.12 
 
 
622 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  28.57 
 
 
637 aa  62.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  26.52 
 
 
650 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.32 
 
 
668 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  24.22 
 
 
617 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.31 
 
 
664 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.46 
 
 
672 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  32.58 
 
 
674 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
690 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  26.01 
 
 
670 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.4 
 
 
636 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.31 
 
 
677 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
592 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
462 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  30.97 
 
 
800 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.14 
 
 
725 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.62 
 
 
689 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.96 
 
 
674 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  26.8 
 
 
612 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.14 
 
 
727 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.14 
 
 
711 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0107  magnesium chelatase  25.34 
 
 
178 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0353838  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.14 
 
 
721 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  33.64 
 
 
626 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.3 
 
 
600 aa  56.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.22 
 
 
616 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 
411 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.58 
 
 
701 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.25 
 
 
703 aa  54.3  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.19 
 
 
680 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  26.37 
 
 
257 aa  54.3  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.93 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  26.86 
 
 
717 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  33.64 
 
 
638 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  30.36 
 
 
683 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  26.29 
 
 
690 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  31.78 
 
 
587 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1621  magnesium chelatase subunit D  29.2 
 
 
625 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.893519  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  27.45 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  31.72 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  23.79 
 
 
621 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  25.41 
 
 
892 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.84 
 
 
566 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  29.82 
 
 
714 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.66 
 
 
618 aa  51.6  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  23.53 
 
 
619 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  26.99 
 
 
605 aa  50.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.47 
 
 
619 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.15 
 
 
618 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  29.92 
 
 
654 aa  50.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  29.91 
 
 
349 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  34.09 
 
 
738 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.13 
 
 
620 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  25.39 
 
 
580 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  28.3 
 
 
485 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.71 
 
 
618 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
412 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.84 
 
 
788 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  25.34 
 
 
317 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.95 
 
 
730 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 
230 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.87 
 
 
1033 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  24.57 
 
 
618 aa  47.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
615 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.13 
 
 
608 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.92 
 
 
423 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 
383 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>