92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2070 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 776 aa  1609    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  30.73 
 
 		 750 aa  241  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.45 
 
 		 712 aa  238  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.15 
 
 		 791 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.69 
 
 		 755 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.8 
 
 		 794 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 819 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.92 
 
 		 751 aa  225  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  28.5 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  27.59 
 
 		 761 aa  221  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  28.84 
 
 		 774 aa  221  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  27.59 
 
 		 711 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.35 
 
 		 755 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.38 
 
 		 760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.67 
 
 		 1362 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.75 
 
 		 831 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.28 
 
 		 759 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.68 
 
 		 738 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  27.52 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.4 
 
 		 772 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.76 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.93 
 
 		 732 aa  202  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.1 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.81 
 
 		 772 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.45 
 
 		 812 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.8 
 
 		 723 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.64 
 
 		 701 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.81 
 
 		 771 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.15 
 
 		 771 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.3 
 
 		 795 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.69 
 
 		 691 aa  192  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.25 
 
 		 740 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.89 
 
 		 796 aa  191  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.62 
 
 		 701 aa  189  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.73 
 
 		 725 aa  187  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.91 
 
 		 776 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.53 
 
 		 671 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.07 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  25.41 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  24.53 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 		 833 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 840 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.45 
 
 		 1033 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.23 
 
 		 786 aa  165  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24 
 
 		 753 aa  157  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.44 
 
 		 729 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  28.51 
 
 		 1109 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.06 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  20.35 
 
 		 713 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  19.71 
 
 		 775 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.01 
 
 		 338 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  23.31 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.58 
 
 		 418 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.16 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.91 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.6 
 
 		 459 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 425 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.12 
 
 		 423 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.57 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  30.63 
 
 		 382 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  23.44 
 
 		 425 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 536 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 		 363 aa  51.2  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 842 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 421 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  22.59 
 
 		 426 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 888 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  22.97 
 
 		 505 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 		 514 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  18.99 
 
 		 959 aa  47.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 551 aa  47.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  22.76 
 
 		 356 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  32.63 
 
 		 523 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 903 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.49 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.56 
 
 		 442 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 654 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  23.46 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  31.43 
 
 		 1077 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  20.49 
 
 		 472 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  22.57 
 
 		 419 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  29.06 
 
 		 942 aa  44.3  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>