67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2675 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  70.01 
 
 
774 aa  1063    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  58.82 
 
 
982 aa  826    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  100 
 
 
777 aa  1557    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  27.65 
 
 
971 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  25.48 
 
 
1215 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  25.48 
 
 
1215 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  24.11 
 
 
1215 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  24.11 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.84 
 
 
1215 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  41.46 
 
 
3027 aa  61.2  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  31.5 
 
 
560 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  28.65 
 
 
787 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 
1188 aa  58.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  23.44 
 
 
927 aa  57.8  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  31.62 
 
 
1309 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  27.5 
 
 
874 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  28.45 
 
 
892 aa  56.2  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  34.19 
 
 
795 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  28.57 
 
 
868 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1491  hypothetical protein  27.48 
 
 
1258 aa  55.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.813394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  25.32 
 
 
924 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  32.64 
 
 
851 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 
308 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  26.56 
 
 
751 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.78 
 
 
643 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
625 aa  52  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.73 
 
 
1045 aa  51.2  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.97 
 
 
307 aa  51.6  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  35.34 
 
 
427 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  33.64 
 
 
811 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 
334 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 
313 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.02 
 
 
1033 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  35.78 
 
 
842 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  34.45 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  27.09 
 
 
888 aa  48.9  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 
828 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
411 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  34.48 
 
 
436 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  33 
 
 
479 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  23.6 
 
 
316 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  33.94 
 
 
903 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 
681 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  34.58 
 
 
788 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
847 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 
1100 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  23.97 
 
 
715 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.48 
 
 
344 aa  45.8  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.48 
 
 
344 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  32.06 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.74 
 
 
474 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  27.56 
 
 
1017 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2505  von Willebrand factor, type A  23.45 
 
 
430 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  36.54 
 
 
902 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  31.93 
 
 
334 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
420 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
319 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 
462 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
340 aa  44.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  33.33 
 
 
633 aa  44.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  50.91 
 
 
774 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  25 
 
 
770 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  29.25 
 
 
319 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  27.93 
 
 
1311 aa  44.3  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  43.48 
 
 
412 aa  44.3  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  40.98 
 
 
340 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  30.51 
 
 
781 aa  44.3  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>