92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1277 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  47.46 
 
 
760 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  49.34 
 
 
770 aa  672    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
781 aa  1570    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  50.07 
 
 
1045 aa  665    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  44.15 
 
 
744 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  45.71 
 
 
747 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  41.82 
 
 
806 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  41.07 
 
 
768 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  43.68 
 
 
763 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  44.13 
 
 
763 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  43.64 
 
 
771 aa  525  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  44.15 
 
 
746 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  43.19 
 
 
764 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  41.17 
 
 
811 aa  465  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  36.78 
 
 
825 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.75 
 
 
927 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.86 
 
 
795 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.51 
 
 
795 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.68 
 
 
795 aa  290  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.68 
 
 
795 aa  290  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.38 
 
 
795 aa  290  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.38 
 
 
795 aa  290  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.25 
 
 
795 aa  287  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.3 
 
 
796 aa  286  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.56 
 
 
796 aa  282  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.3 
 
 
796 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  30.71 
 
 
924 aa  278  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  33.7 
 
 
799 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  35.9 
 
 
795 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  31.51 
 
 
751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  33.23 
 
 
796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  33.54 
 
 
799 aa  272  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  34.7 
 
 
799 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  34.52 
 
 
799 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  34.53 
 
 
799 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  34.53 
 
 
799 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  34.53 
 
 
799 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  34.53 
 
 
799 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  34.53 
 
 
799 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.1 
 
 
795 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  33.18 
 
 
794 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  31.58 
 
 
795 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  33.38 
 
 
795 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  30.83 
 
 
812 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  32.22 
 
 
918 aa  258  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  32.83 
 
 
794 aa  257  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  29.58 
 
 
965 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  29.71 
 
 
951 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  28.79 
 
 
936 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  28.39 
 
 
936 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  27.25 
 
 
856 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  26.61 
 
 
938 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  27.96 
 
 
945 aa  208  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  28.78 
 
 
951 aa  204  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  26.94 
 
 
869 aa  198  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  27.39 
 
 
935 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  28.83 
 
 
865 aa  190  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  26.42 
 
 
867 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  25.98 
 
 
871 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  25.53 
 
 
865 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  26.63 
 
 
938 aa  177  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  25.95 
 
 
871 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  33.47 
 
 
566 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  36.94 
 
 
633 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3357  hypothetical protein  31.98 
 
 
666 aa  88.6  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00235574  hitchhiker  0.000266176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  27.78 
 
 
513 aa  85.1  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  30.64 
 
 
666 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  29.48 
 
 
666 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  31.28 
 
 
1096 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  30.81 
 
 
1309 aa  75.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  30.17 
 
 
1028 aa  74.3  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  29.66 
 
 
735 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.44 
 
 
1034 aa  71.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  23.13 
 
 
1367 aa  71.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.44 
 
 
1034 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  28.47 
 
 
480 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  25.93 
 
 
1076 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  29.32 
 
 
620 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  38.57 
 
 
1024 aa  58.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  26.1 
 
 
583 aa  57.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  26.88 
 
 
998 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  24.27 
 
 
652 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.61 
 
 
1074 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  31.51 
 
 
566 aa  52  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3710  hypothetical protein  37.25 
 
 
747 aa  51.2  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012547 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  24.75 
 
 
811 aa  50.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  28.06 
 
 
1378 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  26.19 
 
 
560 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  27.69 
 
 
982 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  27.1 
 
 
868 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  25.17 
 
 
984 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 
777 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>