59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3011 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  56.94 
 
 
982 aa  786    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  70.01 
 
 
777 aa  1055    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
774 aa  1559    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  29.15 
 
 
971 aa  78.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  24.79 
 
 
1215 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  40 
 
 
3027 aa  66.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  24.52 
 
 
1215 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  22.87 
 
 
1215 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  22.59 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.59 
 
 
1215 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  34.45 
 
 
787 aa  61.6  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  27.32 
 
 
874 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  30.17 
 
 
892 aa  61.6  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  32.14 
 
 
1188 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 
625 aa  58.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
795 aa  56.6  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.01 
 
 
1045 aa  55.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  28.69 
 
 
560 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 
888 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  36.7 
 
 
436 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.26 
 
 
927 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  27.68 
 
 
868 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
427 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  28.32 
 
 
307 aa  52.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1491  hypothetical protein  28.95 
 
 
1258 aa  52  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.813394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.95 
 
 
643 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  36.45 
 
 
788 aa  51.2  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
313 aa  51.2  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  27.47 
 
 
715 aa  50.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 
851 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
418 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
328 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  28.4 
 
 
1017 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  30.25 
 
 
1309 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
316 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3178  hypothetical protein  24.56 
 
 
405 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 
308 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  30.11 
 
 
1154 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 
1336 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
419 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  34 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
420 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
334 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 
1797 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  32.06 
 
 
318 aa  46.2  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 
339 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  28.68 
 
 
751 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  33.94 
 
 
842 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  34.58 
 
 
811 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  32.82 
 
 
334 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  36.26 
 
 
681 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  36.47 
 
 
903 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  38.3 
 
 
462 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.66 
 
 
336 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.69 
 
 
416 aa  44.3  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.84 
 
 
317 aa  43.9  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  31.09 
 
 
340 aa  44.3  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>