16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1317 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1317  von Willebrand factor type A  100 
 
 
1017 aa  2076    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000794512  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  33.15 
 
 
698 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
579 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
1077 aa  50.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  24.28 
 
 
335 aa  48.5  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  24.28 
 
 
335 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  31.33 
 
 
582 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 
609 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 
335 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.65 
 
 
592 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  29.68 
 
 
356 aa  46.2  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  32.17 
 
 
788 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 
327 aa  45.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
792 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  31.29 
 
 
328 aa  45.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
546 aa  45.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>