20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1710 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 698 aa  1400    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1317  von Willebrand factor type A  33.15 
 
 		 1017 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000794512  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  25.23 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  32.47 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  31.16 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.42 
 
 		 3027 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1466  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  25.47 
 
 		 715 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 		 324 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 625 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 562 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 335 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  25.23 
 
 		 763 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 744 aa  45.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 		 335 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  20.74 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 		 547 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>