29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0400 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  100 
 
 
476 aa  956    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  36.38 
 
 
425 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  40.38 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 
432 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  37.41 
 
 
428 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  37.03 
 
 
450 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  36.99 
 
 
431 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  35.1 
 
 
440 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  36.15 
 
 
432 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
962 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.44 
 
 
740 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  23.06 
 
 
464 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.52 
 
 
459 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  31.85 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
418 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  33.86 
 
 
145 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 
419 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
419 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.06 
 
 
794 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  25.06 
 
 
467 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  35.34 
 
 
903 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.23 
 
 
791 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.3 
 
 
643 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  22.69 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 
819 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
415 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>