59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2461 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  100 
 
 
432 aa  856    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  45.5 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  44.74 
 
 
431 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  41.09 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  42 
 
 
428 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  41.41 
 
 
425 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  36.1 
 
 
425 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  43.11 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  36.15 
 
 
476 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  40.56 
 
 
464 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
962 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.09 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.23 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
412 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  32.44 
 
 
761 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.75 
 
 
791 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.52 
 
 
755 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.01 
 
 
755 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  37.89 
 
 
145 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.33 
 
 
759 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 
903 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  29.38 
 
 
750 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.19 
 
 
771 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.66 
 
 
772 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 
892 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.58 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.38 
 
 
751 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.12 
 
 
740 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.29 
 
 
794 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  26.64 
 
 
789 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.66 
 
 
772 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.57 
 
 
771 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.8 
 
 
723 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
418 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
842 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.13 
 
 
725 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.22 
 
 
722 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  34.09 
 
 
851 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  32.28 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  29.71 
 
 
755 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.2 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 
819 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 
607 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
847 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
592 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>