12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4249 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.832481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0368  von Willebrand factor type A  68.28 
 
 		 428 aa  184  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00177271  decreased coverage  0.000715031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  48.95 
 
 		 425 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  51.33 
 
 		 432 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  48.63 
 
 		 450 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  46.98 
 
 		 440 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  46.9 
 
 		 431 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  43.45 
 
 		 425 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  33.86 
 
 		 476 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2461  von Willebrand factor type A  37.89 
 
 		 432 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0207463  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 464 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  41.27 
 
 		 962 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>